La Carrera de Indias se inció en 1525 con la intención de proteger la navegación de los barcos que iban o venían de América y duró hasta el muy avanzado el siglo XVIII. Era una flota de más de 50 barcos, galeones armados con cañones que se reunían dos veces al año, para dar el salto del Atlántico y estaba formada por galeones y llevaba también buques de Guerra, era mandada por un almirante transportaba el comercio europeo hacia América y también llevaba la carga del Galeón de Manila. Se reunían con destino a la península, en la Habana, los viajes anuales abarcaron tres siglos y se destino podía ser La Coruña, Lisboa, Sevilla o Cádiz de vuelta y de ida la Habana, Veracruz, Porto Bello, Cartagena de Indias y Manila y estaba organizada por la Casa de Contratación de Indias en Sevilla o Cádiz, cuando se trasladó allí.
Habría que distinguir entre la flota de Nueva España y la flota de Tierra Firme, solían hacer el viaje juntas desde la Habana a España, la flota al llegar a la Habana de España, una iba a Veracruz en Nueva España y otra se dirigía a Cartagena de Indias y terminaba en Portobelo o Nombre de Dios de allí se llevaba la mercancía al Puerto de Panama para su distribución por el Pacífico, hacia El Callao en el Perú o Valparaiso en Chile, o si no por el Atlántico hasta Maracaibo en Nueva Granada y lo mismo de regreso, la flota de Nueva España trasportaba los productos hasta Acapulco y de allí a Manila en Filipinas.
Con todo lo que se ha dicho, los piratas nunca fueron un gran problema para la Armada ni para la Flota de Indios, gracias a la excelente organización del monopolio que ejerció la Casa de Contratación y la organización en flotas armadas que hacia casi imposible el ataque de navíos de otros países, corsarios o mucho menos piratas.
Las naves de guerra o Guarda estaban formadas por la Capitana y la Almiranta y dos más, la primera iba en cabeza y marcaba la marcha de las demás, era igual a la más lentas de la flota y por la noche portaba un farol en popa para que los demás navíos la siguieran, la segunda iba al final de la flota y portaba el estandarte, las otras galeras de Guarda se situaban a barlovento, para un rápido socorro cuando fuera necesario, aunque todos los galeones iban con cañones.
El tráfico comercial y de riqueza en oro y plata fue fundamental para las dos partes el Nuevo y el Viejo Mundo, pues sin la plata que vino de América no se hubiera desarrollado el comercio ni la economía en Europa, como tampoco habría desaparecido las hambrunas que de tanto en tanto le azotaban, gracias a la patata y el maíz, como tampoco habría llegado la ganadería ni el trigo y la cultura occidental a las nuevas tierras, aunque llegaron muchas enfermedades.
El tráfico comercial y de riqueza en oro y plata fue fundamental para las dos partes el Nuevo y el Viejo Mundo, pues sin la plata que vino de América no se hubiera desarrollado el comercio ni la economía en Europa, como tampoco habría desaparecido las hambrunas que de tanto en tanto le azotaban, gracias a la patata y el maíz, como tampoco habría llegado la ganadería ni el trigo y la cultura occidental a las nuevas tierras, aunque llegaron muchas enfermedades.
La flota salía del Puerto de Santa María por el Mar de las Yeguas hasta Canarias donde repostaban y se suministraban de agua y de allí por el Mar de las Damas hasta la Habana, tenía este nombre por los vientos Aliseos que hacían fácil la navegación, allí se separaban las flotas, la de Nueva España iba a Veracruz y la otra, la de Tierra Firme se dirigía a Panamá y Cartagena de Indias.
En la Habana se volvían a reunir la flota de Nueva España y de Tierra Firme, para dar el salto por el Atlántico a España metiéndose en la Corriente del Golfo, llevando los cargamentos de oro, plata y el Quinto Real, parte de la riqueza correspondiente a la corona, siendo los lugares más peligrosos el paso entre las Bahamas Florida y desde las Azores o Terciarias hasta la Península.
El intento más importante de deshacer este sistema fue el británico que quiso realizar un cordón sanitario en las islas del Caribe, así en la Guerra del Asiento o de la Oreja de Jenkins intentó bloquear el comercio marítimo, con el ataque en la Florida, para bloquear el paso de las Bahamas, Portobelo para cortar el tráfico con la parte sur del Pacífico, la Habana para bloquear la base de la Carrera de indias y por último Cartagena de Indias, como entrada al subcontinente sur de América, donde Blás de Lezo destrozó la flota inglesa y también en la Florida fracasaron, gracias a los esclavos liberados por los españoles, pero si tuvieron éxito en la Habana que se terminó cambiando por la Florida, restableciéndose la Carrera hacía y desde España como siempre, años después se recuperó la Florida.